تاریخ مشروطیت را شاید بتوان از جهاتی تلخ‌ترین دوران مرجعیت شیعه دانست. بزرگ‌ترین مراجع فقهی، روی در روی هم کشیدند و به یکدیگر پرداختند. دو طرف دعوای روحانیت، علاوه بر اینکه نزاع تئوریک می‌کردند، اسیر خشونت‌های عملی و فیزیکی هم قرار گرفتند.